دانشکده فنی و مهندسی جوانترین دانشکده دانشگاه خوارزمی است که در سال ۱۳۸۲ به منظور تربیت مهندسان توانمند و خلاق با استفاده از بالاترین استانداردهای آموزشی و پژوهشی جهت آماده‌سازی آنان برای ارائه خدمات حرفه‌ای مرتبط با تخصص و یا ادامه تحصیل تا مقطع دکتری تاسیس شده است. در حال حاضر دانشکده با پنج گروه آموزشی مهندسی کامپیوتر، مهندسی عمران، مهندسی صنایع، مهندسی مکانیک و مهندسی برق در مقاطع کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری فعالیت دارد.